رسانهها به نقل از منابع آگاه در میان طالبان، گزارش دادهاند که شماری از فرماندهان طالبان به ظن همکاری با طالبان پاکستانی در مناطق جنوب شرقی کشور بازداشت شدهاند.
پایگاه خبری روایت، به نقل از منابعی در درون طالبان، گزارش داده که طالبان در ولایتهای جنوب و جنوب شرقی کشور، به ویژه در ولایتهای خوست، پکتیا و پکتیکا، شماری از فرماندهان خود را به خاطر همکاری با طالبان پاکستان بازداشت کردهاند.
در گزارش آمده که یکی بازداشت شدگان، یک فرمانده محلی طالبان به اسم«سنگری» در شهرستان «مندوزی» است که از چهرههای شناخته شده و طرفدار طالبان پاکستان به شمار میرود.
همکاری با طالبان پاکستان در جذب نیرو اتهامی است که به افراد بازداشت شده وارد شده است.
گفته شده که طالبان افغانستان نگران قدرتمند شدن طالبان پاکستان و پیوستن افراد ناراضی خود به صف این گروه هستند.
مقامهای پاکستانی بارها ادعا کردهاند که طالبان پاکستان در مناطق جنوب و جنوب شرق افغانستان پایگاه و مراکز آموزشی دارند. طالبان افغانستان این ادعا ها را رد کرده اما گزارشها در مورد بازداشت شماری از فرماندهان طالبان به اتهام همکاری با طالبان پاکستان، تایید کننده ادعای مقامهای پاکستان است.
تحریک طالبان پاکستان-تی تی پی، گروهی شبهنظامی و تندرو است که در سال ۲۰۰۷ با به هم پیوستن ۱۳ گروه شبهنظامی در محوریت لشکر طیبه ایجاد شد. نخستین رهبر این گروه، بیتالله محسود بود که در حمله هوایی ارتش پاکستان کشته شد.
طالبان پاکستان در کنار طالبان افغانستان علیه دولت افغانستان جنگید و بنا به اظهارات مولانا فضل الرحمان رهبر جمعیت علمای اسلام پاکستان، حدود سی هزار ملیشه از طالبان پاکستان در کنار طالبان افغانستان علیه نظام دموکراتیک در افغانستان جنگدیدند.
اما با برگشت طالبان افغانستان به قدرت، مقامهای پاکستانی مدعی شدهاند که ناامنیها در این کشور تا هفتاد درصد افزایش یافته و عامل عمده آن طالبان پاکستان است که از حمایت طالبان افغانستان برخوردارند.
منابع امنیتی آگاه در افغانستان میگویند که طالبان افغانستان در رابطه به چگونگی برخورد با طالبان پاکستان اختلاف نظر دارند. برخی از مقامهای طالبان، خواهان حمایت از طالبان پاکستان و ادامه همکاری با آنان هستند اما گروهی دیگر تحت تاثیر پاکستان، خواهان سرکوب طالبان پاکستان هستند. اما چون این دو گروه از بسیاری جهت شبیه هماند و پیوندهای قومی و ایدیولوژیک زیادی میان آنان وجود دارد، تفکیک آنان از همدیگر دشوار است.
هم طالبان پاکستان و هم طالبان افغانستان از نظر قومی، پشتونتبار هستند و سیاستهای قومی مشابهی را در دو کشور افغانستان و پاکستان دنبال میکنند.