منابع محلی در ولایت بدخشان میگویند که طالبان محلی از تقرر فرمانده امنیه پشتونتبار برای این ولایت به شدت ناراضاند و از اشتراک در مراسم معرفی او خودداری کردهاند.
به گفته منابع، فردی بهنام مولوی عبدالبصیر مظهری از طالبان پشتونتبار بهعنوان فرمانده امنیه جدید بدخشان تعیین گردیده و روز شنبه، ۱۱ دلو/بهمن، بدون حضور طالبان محلی و باشندگان محل معرفی و به کار آغاز کرده است.
بدخشان از ولایتهای تاجیکنشین است که اختلاف و تنش میان طالبان محلی و طالبان پشتونتبار جنوبی در آن همواره مطرح بوده است.
در گذشته بارها طالبان محلی بدخشان خواهان تقرر مقامهای محلی از میان خود شان بوده و از رفتار تبعیضآمیز طالبان پشتونتبار شکایت داشتهاند. طالبان اما به اعتراضات و مخالفتهای طالبان محلی بدخشان اعتنا نکرده و مقامهای محلی این ولایت را از میان طالبان پشتونتبار برگزیدهاند.
منابع محلی میگویند که در رأس تمام ادارات کلیدی بدخشان پشتونها قرار دارند و طالبان محلی هیچگونه صلاحیتی در تصمیمگیری ندارند.
بدخشان از معدود ولایتهایی است که بیشترین طالبان محلی را در خود جا داده است.
فعالان سیاسی و مدنی بدخشان با انتقاد از طالبان محلی، میگویند که آنان در نقش پیشمرگه برای استقرار رژیم طالبان در شمال زیاد جان فشانی کردند اما به محض به قدرت رسیدن طالبان، همکاران بدخشانی این گروه در معرض برنامه تصفیه قومی قرار گرفته و دست شان از اداره امور حتا ولایت خود شان کوتاه شد.