مولوی حبیب‌الله حسام رییس شورای علمای جبهه مقاومت، به رهبری احمد مسعود، گفته که طالبان به نیابت از هند علیه پاکستان می‌جنگند و احساسات مردم را تحت نام ملی‌گرایی تحریک کرده و آنان را می‌فریبند.
آقای حسام در مطلبی تحت عنوان« جنایتکاران منتظر عواقب خود باشند» نوشته است:«مردم ما بی‌گمان شهود زندهٔ تاریخ خویش‌اند؛ جنایات و تجاوزات سی و یک‌سالهٔ آن گروهِ نیابتی در هماهنگی با نیروهای پاکستان را هرگز از یاد نبرده‌اند. آنها را که با کشتارِ دسته‌جمعی، پدید آوردنِ سرزمینِ سوخته، آوارگیِ همگانی، مصادرهٔ مادیّات اولیه و انتقالِ جمعیِ آسیب‌دیدگان و تحویلِ فجیعِ ناموسی به سوی پاکستان، زخم‌هایی عمیق بر پیکرِ جامعه زدند، همهٔ این‌ها در خاطرِ شریفِ مردم حک شده است. کشتار شهروندان، رهبران سیاسی و فرماندهان به‌واسطهٔ بم‌گذاری، مسلسل‌کشی، ترور و عملیاتِ انتحاری در بازارها، مساجد، نمازهای جمعه، اعیاد، مکتب‌ها و دانشگاه‌ها، بیوه و یتیمان میلیونی، هنوز در حافظهٔ جمعی ما روشن و تازه است.»
رییس شورای علمای جبهه مقاومت در ادامه نوشته است؛«این گروهِ متعصّب و تکفیری در طولِ سی و یک سال، به‌پاسِ هماهنگی با منافعِ بیگانهٔ پاکستان، از هیچ جنایتی فروگذار نکرد؛ و امروز نیز، هنگامی که زخم‌ها هنوز التیام نیافته‌اند، دشمنانِ حقیقیِ مردم با نعره‌های نفاق‌افکنِ «ملی‌گرایی» و حیله‌های شیطانی، مردم را به‌نیابت از قدرت‌های خارجی—از جملهِ هند—علیهِ پاکستان می‌فریبند.»
وی افزوده است:«این حقایق تلخ، نشان‌دهندهٔ روزگارِ سیاه و تحمیلِ زندگیِ تلخ بر مردم توسط مزدورانی است که در نقشِ پیادهٔ اجنبی عمل کرده‌اند؛ کسانی که اکنون می‌کوشند بارِ دیگر از احساسِ پاکِ مردم سوءاستفاده کنند و آنها را در بازی‌های خطرناک ویرانگر به‌کار اندازند.»
آقای حسام نوشته است:«ما اکنون پاکستان را کشوری می‌دانیم با مردمانی مسلمان و برادرِ ایمانیِ ما؛ امّا هر جنایتی که از سوی نظامیان یا هر نیرویی علیه مردم روا داشته شده و هر نقشی که گروه‌های نیابتی در آن ایفا کرده‌اند، باید به عواقب آن منتظر باشند و از مردم انتظار همصدایی و حمایت را هرگز نداشته باشند.»
این اظهارات در حالی مطرح می‌شود که جبهه مقاومت بدلیل سکوت در برابر تحولات اخیر و درگیری‌های طالبان و پاکستان با انتقاد مواجه بوده است. منتقدان می‌گویند که جبهه مقاومت باید در این شرایط حساس موضع خود را روشن بسازد.
برخی‌ها از جبهه مقاومت خواسته‌اند که با استفاده از فرصت پیش آمده تحرکات خود را بیشتر کرده و در جهت بسیج نیروهای ملی به منظور کنار زدن طالبان از قدرت تلاش کند.
این جبهه تا کنون موقف رسمی خود را در باره درگیری‌های اخیر میان طالبان و پاکستان اعلام نکرده است.
پیش از برخی از منابع آگاه گفته‌اند که مقام‌های پاکستانی گفت‌وگوهای سری با رهبری جبهه مقاومت در مورد چگونگی مقابله با طالبان انجام داده‌اند. برخی‌ها حتا می‌گویند که دفتر جبهه مقاومت ملی در پاکستان گشایش یافته و هماهنگی میان جبهه و پاکستان در باره تحولات اخیر وجود داشته است. جبهه مقاومت اما این گمانه‌زنی‌ها را رد یا تایید نکرده است.