حمدالله فطرت معاون سخنگوی طالبان در خبرنامه‌ای گفته است که هبت‌الله آخوندزاده، رهبر این گروه در سمیناری که برای ماموران استخباراتی برگزار شده، به آنان دستور داده که ضمن خنثی سازی برنامه‌های پنهان و آشکار دشمن، در «تطبیق شریعت» نیز همکاری نموده و از توهین به ارزش‌های اسلامی جلوگیری نمایند.
براساس خبرنامه، ملاهبت‌الله از اداره استخبارات تمجید نموده و آن را ستون فقرات رژیم طالبان خوانده است.
آگاهان امور می‌گویند که تاکید هبت‌الله بر مشارکت و همکاری اداره استخبارات در آنچه تطبیق شریعت خوانده می‌شود، به معنای گسترش حوزه کاری و صلاحیت‌های استخبارات است و می‌تواند باعث افزایش موارد نقض حقوق بشر و محدودسازی فعالیت اجتماعی شهروندان گردد.
تا کنون مسوول اجرای قانون موسوم به امر به معروف طالبان، ماموران وزارت امر به معروف بودند که به عنوان محتسب شناخته می‌شوند. محتسبان اکثراً افراد عادی و غیرمسلح هستند. اما دستور رهبر طالبان به اداره استخبارات برای همکاری با اداره موسوم به امر به معروف، به معنای نظامی‌سازی و برخورد جدی و خشونت‌بار با پدیده امر به معروف دانسته می‌شود.
در روزهای اخیر، در شماری از ولایت‌ها، والیان طالبان نشست‌هایی را به هدف توضیح و تشریح چگونگی تطبیق شریعت و اهمیت «نظام اسلامی» برگزار کرده‌اند. در این نشست‌ها، روسای ادارات استخبارات حضور داشته و والیان نیز تاکیدی خاصی بر مشارکت و همکاری اداره استخبارات با اداره امر به معروف داشته‌اند.
اداره استخبارات طالبان یکی ازمخوف‌ترین ادارات این گروه است که به شکل گسترده به شکنجه زندانیان، به کشتارهای هدفمند و مرموز و به نقض جدی حقوق بشر می‌پردازد.
نهادهای حقوق بشری، اداره استخبارات طالبان را «خون‌خوارترین» اداره این گروه می‌دانند و خواستار پیگرد مسوولان این اداره در نهادهای عدلی و قضایی بین‌المللی شده‌اند.
براساس گفته‌های زندانیانی که از زندان طالبان رها شده‌اند، در زندان‌های این گروه شدیدترین اشکال شکنجه، از جمله بریدن آله تناسلی، کشیدن ناخن و شاشیدن روی صورت، برای گرفتن اعتراف اجباری استفاده می‌شود. شماری از زنان که تجربه زندان طالبان را دارند، از تجاوز جنسی گروهی در این زندان‌ها و برهنه کردن زندان با هدف گرفتن عکس و فیلم سخن گفته‌اند.
